Да вот нет у меня заявок на руках, но думаю что там скорее всего указано с НДС.
А процедура изменения протокола какая?
Просто исправить и подписать комиссией или где то нужно указать по какой причине изменяем протокол?
У нас все контракты и договоры проходят через казначейство
Если в заявке указано с НДС (не знаю тогда, почему в протоколе иначе стало), то составляете протокол с теми же подписями тех же членов комиссии об исправлении технической ошибки. Что-нибудь вроде: "В целях исправления технической ошибки, допущенной в протоколе рассмотрения и оценки котировочных заявок от ____ №____ в пункте ___ указанного Протокола слова "без НДС" заменить словами "с НДС". Че-нить такое, но пограмотнее... )))
Что у вас за организация и что за казначейство-то? Может я чего не так понимаю...