С возбуждением уголовного дела - труба дело будет.
Незамотивированные правоохранительные органы в лучшем случае возьмут объяснения с директора этого ООО, что он ничего не знает, и сделают отказ в ВУД.
В худшем - и заявление принимать не станут. И для мошенничества надо ещё доказать, что похищенные статьи имели какую-то денежную стоимость.
С судебным приказом - интересный совет. В суды никто оригиналы документов к иску не прикладывает.
Но нельзя исключать возможности, что от имени "честного" ООО действительно орудовали какие-то злодеи (как-то раздобыли печать и подпись директора - скан, и ну ставить их на всех договорах).
Может быть, по специфике статей можно определить отрасль народного хозяйства, где они могут быть использованы. И попробовать поискать эти статьи там?
Но у нас сложное доказывание факта авторства. Выкладывание на Гоголь-диск не так оставляет следы, как направление электронной почтой (но и направление электронной почтой - не панацея, но в этом случае другая сторона должна подоказывать, откуда и каким образом эти тексты могли быть скопипищены, вдруг мама с соседней папки Гоголь-диска загрузила их себе? и теперь выдаёт за свои)