Если я Вас правильно поняла, то истец не может обжаловать решение полностью.Истец вправе обжаловать решение, но только в части взыскания с него госпошлины и только по тому основанию, что не рассмотрение его заявления об освобождении от уплаты незаконно.
Остальных ЛУД это вообще не касается.
Что же делать с исковыми требованиями (в удовлетворении которых отказано)?
Если обжаловать только в части взыскания по тому основанию, что заявление об освобождении от уплаты госпошлины судом рассмотрено не было, то можно ли представить в апелляции, что рассмотрение дела происходило незаконно и следовательно отменить решение как незаконное?