если кто читал закон, то там должно быть четыре условия (назову два):
1. срок владения три и более года.
2. надлежащее перечисление арендной платы в течение срока владения.
Таким образом, если в вашем случае ИП может документально подтвердить платежи , то стоит их увязать с первым условием, которое он таким образом тоже выполнил. Ведь в законе не сказано, что право владения (пользования) должны быть обязательно зарегистрированы. Там речь идет только о непрерывании срока такого владения (пользования).