На самом деле регистрация программы ЭВМ не сложная, но кропотливая работа (вся необходимая информация есть на официальном сайте Роспатента). Главное определитесь, что Вам действительно нужно - зарегистрировать товарный знак или программу ЭВМ. На регистрацию программы, на сколько я помню времени у нас ушло примерно 3 месяца, регистрация товарного знака занимает примерно год.