но если эта земля никаким образом на территорию города не попадает, а она скорее всего туда не попадает, то заявление вам надо подавать в орган местного самоуправления, т.е. администрацию муниципального района, на территории которого этот участок находится. А в администрации уже должен быть орган (например, какой-нибудь комитет по управлению имуществом).
Земля - у вас в собственности. На земле - объект недвижимости, документов о законности его возведения ни у кого нет, следовательно сами можете сказать, что это самовольная постройка, право собственности на которую в силу ст. 222 ГК РФ может быть признано судом за собственником земельного участка. Ваш ответчик - орган местного самоуправления, ведающий вопросами выдачи разрешения на строительство + в случае наличия такового лицо, осуществившее строительство здания. Как то так.