Добрый день, коллеги!
Внимательно посмотрел данную очень интересную тему.
Осмелюсь предложить: для обоснования критерием сравнения работников по квалификации использовать Приказ Минтруда России от 12.04.2013 N 148н
"Об утверждении уровней квалификации в целях разработки проектов профессиональных стандартов". Да, этот документ изначально не имеет прямой связи с ч.1 ст. 179 ТК РФ. Но в отсутствие иных НПА можно на основании заложенных в нем критериев попробовать обосновать различие в уровне квалификации у сокращаемых работников.
Также считаю, что если у двух замов были разные должностные инструкции, в том числе по наименованиям подчиненных отделов, то неверно говорить о том, что имело место сокращение численности (то есть из двух одинаковых штатных единиц остается только одна). Фактически имеет место сокращение штата (то есть в штатном расписании была одна уникальная должность зама и она полностью исключается). В последнем случае приказ о сокращении конкретной штатной единицы не касается иных штатных единиц сходных по названию, но отличающихся по трудовой функции. Поэтому среди всех замов сравнение по ст. 179 ТК РФ проводить не нужно.