заключить 2 договора и не подписать к ним соглашение о зачете?
Вариант. Но не возникнет ли дохода у продавца долей? По вашей схеме мы может заключить один договор цессии прав дольщика (там все понятно и стандартно), а второй то договор будет купли-продажи долей в квартире. У формально у продавца получится доход с которого надо платить налог. Не уверен, что соглашение о зачете здесь нам решит проблему.
К стати, с 250 ГК проблем не будет, так как я собственник доли в квартире, доли в которой собираюсь выменять на студию. Может есть другие варианты?