На мой взгляд, тут важно определить, кто дал поручение и с чьего ведома это произошло.
Например, в случае, если этот физрук пришел в школу в день Х в целях проведения урока (пусть и с ранее данными устными предупреждениями находящегося на день Х в отпуске диретора), то кто-то же направил его именно в нужный спорт зал, вручил ему журнал. Я к тому что, работник все же приступил к работе как мин с ведома представителя работодателя, исполняющего в данный день полномочия директора.
Тогда однозначно: с директора дисциплинарку снять на зауча наложить?