Пишите заявление(в 2-х экз.) на возврат,прилагайте все платежки(свои и банка),сдавайте в канцелярию официально.О случившимся он узнал случайно, после того, как налоговая сама списала недостающую сумму.
Возьмите себе за правило общаться с ними письменно,меньше бреда от ИФНС слышать будете.А их письменный бред всегда можно оспорить.После краткого устного разбирательства налоговая просит