Сварог

Во-первых кажется не целесообразным внесение изменений в уставные доки ООО-2 - в этом необходимость отуствует - о чем изменения то ??

Во-вторых посмотрите внимательно подпадаете ли вы под обязательное рассмотрение реорганизации в ФАСе и что это у вас будет - ходатайство или уведомление (зависит главным образом в данном случае как я понимаю от размера совокупных активов) - если уведомление - то дожидаться ответа ФАС может быть не стоит - потом придет )
Кроме того при передаче книжек трудовых - неплохо бы известить ПФ - воизбежание неточностей а также военно-учетный стол.
если передаточный акт уже утвержден в ООО-2 и ООО-1 выразило согласие на присоеинение ООО-2 на общем собрании дву обществ целесообразнее не подписать, а уже утвердить акт (при этом помня о ФАСе - к этому времени его мнение уже лучше знать)

В общем, ВИП, если обобщать, без заключения письменного договора в котором прописан объем Ваших прав, т.е. что можно делать с данным авторским произведением, то на Вас всегда могут наехать и запретить использование.
Плюс даже если вы зарегистрируете ТЗ его могут аннулировать по возражению на основании п.3 ст.7 Закона

Отвечать будет владелец домена, а также лицо которое непосредственно осуществило нарушение - размещение текста.

Как выход можно размещать не произведение, а его часть - т.е. писать какую-то коротенькую стаью и пихать туда в обоснование своей позиции часть книги - вроде как бы цитировать.
Дело Геворкяна весьма спорно, суд в статус бибилиотеки влезал поверхностно...
Т.е. можно попробовать раздробить текст на несколько статей с цитированием...
В тоже время необходимо проверить правомерность претензий - есть ли у них право на авторское произведение или поручение автора (владельца)
Возможность решить спор полюбовно тоже неплоха.

В тоже время запретить размещение целых произведений несомненно можно, а вот доказать вред (в денежном эквиваленте) будет проблематично.

Да , а лучше все же соответчиком, ну в крайнем случае 3-м лицом.

А к непосредственному нарушителю требования обосновывать причинением вреда.
Добавлено @ 12:37
Тем не менее основания все равно скользкие, может проще с ген. подрядчиком договориться и вставить иск от него, если он передавая доки также ставил условие их конфиденциальности и дальнейшего не использования ...

Нет привлекать нужно именно лицо ответственно по договору - оно то взяло на себя обязательство хранить и не разглашать доки, а остальных уже до кучи - иначе могут отказать или ответчика поменять.
А тот кто фактически использовал может Вам никаких обещаний и не давал, соответственно усложняется процесс...