я бы на вашем месте обжаловал, поскольку в первоначальной претензии вы требовали в том числе уплатить % и неустойку.
а сумма % или неустойки может неоднократно уточняться в процессе рассмотрения дела (ст. 49 АПК РФ)
+ как указано в Определении ВАС (пост 28)
.... Проценты по статье 395 Гражданского кодекса Российской Федерации являются мерой гражданско-правовой ответственности. Данная норма содержит правило о том, что при взыскании долга в судебном порядке суд может удовлетворить требование кредитора, исходя из учетной ставки банковского процента на день предъявления иска или на день вынесения решения.
Из этого следует, что претензия об уплате процентов по статье 395 Гражданского кодекса Российской Федерации может не содержать конкретную сумму, поскольку при ее предъявлении еще не известна дата предъявления будущего иска (по состоянию на которую суд может взыскать проценты), если претензия не будет удовлетворена.