vania-rr, было у меня несколько лет назад подобное дело
муниципалитет продал землю, выдал АПЗ, и уже хотел дать разрешение на строительство
но вдруг оказалось, что это охранная зона какого-то газопровода (кажется)
кто-то кому-то при развале СССР и приватизации что-то не сообщил и не передал
судились они года три-четыре, кончилось тем, что землю вернули муниципалитету, а он возместил все убытки
думаю, что и у Вас дом зарегистрировать не дадут
если долго будут разбираться, выяснится, скорее всего, что при определении охранной зоны у Вас должны были отозвать разрешение на строительство, или как-то сообщить, что строить теперь нельзя
возможно, муниципалитет должен будет возместить Вам затраты на строительство (и возможно - оплатить снос)
кстати, да, в том моём суде на (стадии апелляции уже) выплыл вопрос, разрешает ли владелец опасного объекта с охранной зоной строить что-то на данном участке
владелец заявил, что нет, ибо не желает нести ещё и дополнительную ответственность за вред, причинённый в результате гипотетической аварии
у Вас - было разрешение от Министерства Обороны "в качестве исключения"
если Министерство Обороны и в Вашем деле подтвердит, что можно, то можно