Деловой Юрист

Суть дела такова.
Компания «А» заключила с компанией «Б» договор аренды башенного крана. Арендные платежи должны были вноситься каждый месяц из расчета 2000 р. - 1 маш./ час. Компания «Б» не внесла очередной платеж и компания «А» подала в суд.
В исковом заявлении было указано требование о взыскании не внесенных арендных платежей и неустойки, причем одновременно пени и штрафа. Позднее от взыскания штрафа отказались, оставив только пени.
Суд удовлетворил требование о взыскании не внесенных арендных платежей, а в части пени отказал. Указав следующее:
«Пунктом 5.1. договора установлена пеня за просрочку внесения арендных платежей в размере 0,1 % от суммы договора за каждый день просрочки, вместе с тем, в его тексте отсутствует такое понятие как «сумма договора».
«Предъявляя требование о взыскании пени, истец исходит из суммы задолженности, исчисленной на основе актов оказания услуг, однако понятия «сумма договора» и «сумма задолженности» имеют разное лексическое значение. Так, под суммой договора понимается его цена как элемент договора, а под суммой задолженности - совокупность установленных договором и невнесенных ответчиком арендных платежей».
«Таким образом, условие о размере пени, предусмотренной за нарушение сроков внесения арендных платежей, сторонами не согласовано».
Как быть в такой ситуации? Обжаловать решение? Или все же подавать новое исковое заявление о взыскании процентов за пользование чужими денежными средствами?

Суть дела такова - интернет-магазин продает программное обеспечение, авторами которых являются физические лица. Продажа осуществляется любым заинтересованным лицам, через интернет-магазин, который по своей сути является посредником.

Вопросы:
- Какой договор лучше заключять интернет-магазину и автору?
- Как прописать в договоре способ оплаты (с помощью электронных денег webmoney, яндекс-деньги)?

Заранее спасибо!